Schon in seiner Jugend spielte Benjamin Quabeck Theater und drehte mit der Video-8-Kamera seines Vaters erste kleine Splatterfilme. Nach dem Regie-Studium an der Filmakademie Baden-Württemberg startete seine Karriere mit seinem Debütfilm "Nichts bereuen" nach Quabecks gleichnamigen Roman, in dem Schauspiel-Star Daniel Brühl seine erste Hauptrolle spielte. Ebenfalls als Filmerfolg gefeiert wurde Benjamin Quabecks zweiter Live-Action-Film "Verschwende deine Jugend" mit Tom Schilling und Robert Stadlober.
Mit diesen filmischen Anfängen startete Quabecks lange, vielfältige Karriere als Regisseur, Autor, Produzent und Cutter von Spiel-, Animations- und Dokumentarfilmen für Fernsehen, Theater, Werbung und Musik. Zudem inszenierte er zahlreiche Hörspiele - unter anderem in Erweiterung der Show "Babylon Berlin". 2017 erhielt er unter anderem den Deutschen Radiopreis und 2019 wurde sein Hörspiel "Guter Rat" als Hörspiel des Monats der Deutschen Akademie der darstellenden Künste ausgezeichnet. Für den WDR schrieb und produzierte er ebenfalls verschiedene Hörspiele - zuletzt die Fortsetzung der Krimi-Hörspiel-Reihe um die Ruhrpott-Brüder.